（一）申报表
商务部为申报方制定了一个标准的申报表，[112]该申报表已于2012年7月7日生效。申报表要求各方提供的信息主要包含两方面：①经营者的基本信息和交易信息；②详细的竞争分析。尽管商务部的标准申报表还要求申报方提供大量的其他信息，但其大部分仍与欧盟委员会采用的CO表格类似。
经营者和交易相关部分要求提供交易各方的基本描述，其主要的境外关联实体及中国境内关联实体的基本信息（尤其从事与该交易相关业务的关联实体）、合营企业的基本信息（如有）、交易的基本条款、交易的合理性和动机。申报表同时还要求申报各方提供特定文件，如交易协议和与交易相关的文件、参与集中的经营者的上一财政年度财务报表（经审计），以及与效益相关的内部策略和董事会文件。就要求提供的内部文件而言，商务部希望各方提交内部编制的研究、分析和报告，这些内部文件对交易进行评估或分析，由董事会或高级管理层编制或其他人为其编制，如董事会会议纪要或公司策略文件。这类文件应包含市场份额、竞争条件、实际或潜在的竞争对手、集中的合理性、销售增长或者扩展进入其他产品或地域市场的潜力、总体市场状况、集中带来的协同效应和效率等。就要求提供的外部文件而言，商务部关注的是第三方为交易各方制作的与交易有关的文件或与交易无关但与本次集中所涉及的行业或市场相关的文件。尽管申报表将提供这些内外部文件的要求标注为“可选填”，即申报方可自行决定是否提供，但值得注意的是，如选择不提供，申报方必须说明不提供的具体理由。在实践中，商务部通常将这些内外部文件视为相关且必要的文件，并倾向于要求申报方提供，商务部的文件要求范围介于美国哈特-斯科特-罗迪诺反托拉斯改进法第4（c）条项下的文件审查要求和欧盟的文件审查要求之间，美国的相关要求更宽泛而欧盟的相关要求则相较而言更窄。如果申报方在申报时完全不提供这些文件，商务部仍可能会在受理前的审查或第一阶段的审查中要求其提供。
详细的竞争分析包括对于相关产品市场及地域市场的界定（包含详细的理由）以及交易对市场竞争的影响分析（包含集中各方及主要竞争者的市场份额、供应商和客户的信息、相关市场的供应和需求结构）。
（二）信息公开
《反垄断法》仅要求商务部公开其禁止集中的决定或附加限制性条件批准的决定。
关于申报的保密性，如果申报方不希望披露相关信息，应在申报材料中将其标注为保密，同时还需要提交一份不包含保密信息的申报材料。[113]《反垄断法》规定，反垄断执法机构及其工作人员对执法过程中知悉的商业秘密负有保密义务。[114]2009年的《经营者集中申报办法》同样强调了对于组织各方及个人在审查过程中所知悉的商业秘密和其他保密信息的保密义务。[115]尽管关于保护保密信息的具体实施细则尚未出台，但截至目前，关于商务部向第三方披露申报方的保密信息还没有出现过任何被公开的问题。(www.xing528.com)
（三）审查过程中的正当程序权
在商务部合并审查过程中，就正当程序给予申报方明确的权利及其他法律指引的情况非常有限。显然，商务部也仅受审查期限、对敏感信息保密的要求（至少包含申报方所标注的保密信息）及以书面形式公布禁止决定或附条件批准决定等方面的约束。[116]商务部也可以主动或应申报方的要求举行商谈以对案件进行讨论。
实践中，在审查过程中，申报方和第三方可以自由地向商务部提交有关信息，可以与案件审查组讨论审查进度和情况，同时也可以以书面形式邀请审查小组进行面对面的会谈，对案件进行交流。尽管商务部没有接受会议邀请的义务且也没有就审查进展进行定期会议的义务，但如果案件审查小组认为这样的会议对审查有帮助，仍然会同意会见申报方或第三方。该会议在商务部进行，会议语言为中文。为了审查小组能更好地了解相关产品市场，申报方还可以邀请案件审查小组进行现场参观。与其他竞争执法机构不同，商务部案件审查小组更倾向于面对面方式而非电话方式交涉一些重要问题。
（四）上诉和行政诉讼
根据《反垄断法》的规定，对商务部集中审查决定不满的一方在知道集中审查决定之日起60日内可向商务部申请行政复议。[117]如果申请方对商务部的行政复议结果依旧持有异议，可以在收到行政复议决定之日起15日内向人民法院提起行政诉讼。[118]行政复议和行政诉讼的期限分别为60日和3个月。[119]目前为止，还没有针对商务部的决定提起的行政诉讼。
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