首先，日本东盟外交政策受美国影响较大。战后日本外交是建立在日美同盟基础上的。在冷战的大背景下，日本的东南亚政策从一开始就打上了美国的烙印，直至今天美国因素仍然影响着日本与东南亚国家关系的发展。例如，与东南亚国家的经济外交是通过“赔偿外交”建立起来的，而“赔偿外交”则是在美国安排下进行的。东盟成立之后，日本东盟外交政策的变化，也受到来自美国因素的影响。20世纪70年代，美国势力相对衰落，逐步实行战略收缩。“福田主义”就是在此背景下出台的。冷战结束后，日本加强了与东盟的政治合作，外交自主性进一步提高，但这也离不开与美国的协调。在与东盟的交往中依然是以对美协调为主。1997年东南亚金融危机爆发后，日本曾积极支持东盟的倡议，建立“亚洲货币基金”，但该计划遭到美国反对，结果日本不得不放弃。
其次，日本与东南亚国家关系具有特殊性。这一特殊性不仅体现在东南亚与日本的关系上，也反映在东南亚内部国家之间。在第二次世界大战中，菲律宾是东南亚各国中受日军侵略而造成伤亡最多的国家。当时菲律宾是美国的殖民地，日本进攻菲律宾并把美军赶出菲律宾，然而美军不久又反击并重新夺回菲律宾。在这场战争中，估计有近一百万菲律宾民众死伤。战争受害仅次于菲律宾的是新加坡。在新加坡，华侨组织起“义勇军”对日军进行抵抗，还发起筹款运动筹集“义捐金”，并发起抵制日货运动，因此日军在新加坡的屠杀是针对华侨的，被杀华侨人数从数千人至5万人说法不一，而日军与当地马来人则关系较好。
第二次世界大战后期，日本奉行“南下政策”，侵占了东南亚，但时间不长只有三年多。在占领期间，日军推翻了中南半岛的原有殖民当局，让一些东南亚国家实现“独立”，并扩大了当地精英的参政比例，这导致战后东南亚国家的很多军政领导人都跟日本有过合作。例如，现在缅甸领导人昂山素季的父亲昂山将军组建的缅甸独立军就由日军训练，并同日本人一起与英军和中国远征军作战。这一历史确实减弱了东南亚当地居民的反日情绪。(www.xing528.com)
另外，日本与东南亚各国均已签署战争赔偿协议，已不存在历史遗留问题，也没有领土纠纷。尽管东南亚各国当时均对日本的赔偿金额存在不满，但在美国的干预下，以及当时东南亚国家普遍想引进日本的资金发展本国经济的情况下，各国先后接受日本的赔偿方案。经过战后日本40多年持续对东南亚国家的经济援助和文化交流，东南亚国家普遍认为东南亚与日本相互仇视的一页已经“翻过去”。
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