任何分析方法都有其局限性，而财务报表分析的局限性，首先来自于财务报表本身的局限性。
财务报表本身是基于一定的假设而制定的，如果假设条件发生改变，所有的结果都会发生改变。具体体现在以下三方面。
第一，财务报表没有披露企业的全部信息，管理层拥有更多的信息，披露的只是其中的一部分。
第二，已经披露的财务信息存在会计估计误差，不一定是真实情况的准确计量。
第三，管理层的各项会计政策选择，可能使财务报表扭曲企业的真实情况。比如说，企业为了调节利润，可能会把下一个期间的费用计入，导致当期利润的减少。
其次，财务报表分析的局限性也体现在，财务报表有时并不那么靠谱。常见的危险信号有以下五点。
第一，财务报告的形式不规范，不规范报告的可靠性也应受到怀疑。
第二，要注意分析数据的反常现象。比如说，中国上市公司如果连续三年亏损，就会被给予退市风险警示。而这些上市公司为了不被要求退市，人为地将财务报表做成两年亏损、一年盈利。
第三，要注意大额的关联方交易。
第四，要注意大额资本利得。比如说企业的主营业务不赚钱，但它依靠交易性金融资产获利，让自己的报表变得好看，这是需要警惕的。
第五，要注意异常数据的审计报告，无正当理由更换注册会计师，或审计报告附有保留意见，暗示企业财务报告可能存在过度粉饰问题。(www.xing528.com)
再次，财务指标的经济假设问题。这是指，财务分析需要先消除不同企业或不同时期的规模差异，再进行比较。我们使用一些比率进行财务分析，但这些比率本身是有缺陷的，只是因为没有更好的选择，所以我们选择假设性的、有缺陷的指标进行分析。
举例来说，存货周转率=销货成本÷平均存货，这意味着销货成本与存货周转率之间存在固定不变的比率关系。但事实上，销货成本与需求量有关。
此外，即使没有固定要素，暗含在分子与分母间的线性关系假设也未必正确。
最后，比较基础的问题，也会造成财务报表分析的局限性。比较基础的问题是指在比较分析时必然要选择比较的参照标准，包括本公司历史数据、同业数据和计划预算数据。但这些数据都只是参考，同业未必优异，历史数据也未必准确，预算可能并不靠谱。
横向比较时，需要使用同业标准。同业标准的平均数只有一般性的指导作用，不一定有代表性，不是绝对的合理性标志。
趋势分析以本公司的历史数据做比较基础，历史数据代表过去，并不代表这样的分析具有合理性。
实际与计划的差异分析，以计划预算做比较基础。实际和预算出现差异，可能是执行中有问题，也可能是预算本身不合理，两者的区分并非易事。
但我们并不能因为这些假设因素对分析结果有影响，就不做分析。就像我们不能因为自己有一天会死去，就不好好活着一样。只是分析的时候，要对条件做具体细分，对具体情况做具体处理。
[1]本篇所有表格数据均未经修约。
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