运河遗产除了其历史文化价值外，运河的水体及其护岸植被也为其带来了自然生态价值，运河的开凿增加了运河古镇的滨水空间，附近的植被和湿地也具有绿隔的作用，运河的水生态、水景观共同形成的自然绿色空间具有显著的生态价值和功能。在运河古镇发展中，受水体污染、河流干涸、河道填埋等因素影响，运河生态环境价值难以实现。发掘和提升运河作为生态廊道、景观廊道的价值也是运河古镇实现绿色转型发展的重要任务和途径。推进运河生态环境治理，一是要严格控制污染物排放，通过开展运河水生态环境调查掌握运河的主要污染物类型和来源情况，通过增加水文环境检测设施，引进智能化设备，建立运河水功能区的动态监测体系，通过淘汰高污染的船型，鼓励船舶改造油气收集系统，降低通航运河段的污染物排放。二是推进生态修复工程，将运河作为绿色基础设施，结合运河水利设施修复和建设，通过系统性的生态修复工程，恢复运河的水生态系统，并提升运河两岸的生态环境品质，拓展运河古镇的绿色生态空间。例如，安徽淮北整合采煤塌陷区治理与运河治理资金，系统推进城市的生态环境治理，扬州市依托高邮湖和三万片区退圩还湖项目。修复和改善运河遗产的周边环境，扬州市宝应县整合水利和城建资金，在生态修复的同时，还打造形成运河风光带。三是岸线两侧的清理，运河生态环境的污染，很大的原因是由于建设控制不力，大运河的河道长期被侵占，运河两岸的工厂和居民向运河排污，开展运河岸线的整顿和清理工程，是治理运河生态环境的根本途径。扬州市宝应县配合生态修复工程，对京杭大运河两岸的临时砂石装卸点、船厂、制砖厂及各类临时堆场予以取缔，对堤顶及迎水面堤坡房屋予以拆除，对运河沿线两侧各1公里范围内的养殖场、砖瓦窑等污染严重的中小企业进行清退，根治运河的水环境污染问题，保证运河生态环境进入从修复到改善的良性循环进程。(www.xing528.com)
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