由于引入系统的供应链管理思想和方法较晚，我国企业供应链管理水平与国外企业相比差距较为明显，特别是中小企业的供应链管理和协作水平较低。我国管理学界的学者对此进行了研究，发现企业供应链管理水平不足的背后隐藏着诸多深层次的问题。
1.企业对供应链管理的认识严重不足
我国多数企业缺乏供应链思维，对内没有设置供应链管理部门，缺乏统一协调计划、采购、生产、销售等活动的专职部门，对外没有和供应链上下游企业形成有效协同和合作共赢的供应链管理机制[3]；企业“贪大求全”的传统观念长期存在，与供应链伙伴资源共享、互利共赢的意识不足，企业发展观念急需尽快改变[4]。
2.企业组织结构落后，不适应供应链管理的要求
我国大多数企业的组织结构都是建立在职能分工的基础上，采取传统的“金字塔”型直线制结构。这种组织结构虽然分工明确，便于管理，但往往容易造成企业内信息流通不畅、流程割裂、授权不足、分工过细，各职能部门只注重自身利益、追求局部最优[5]。由于内部供应链协同水平不足，导致企业对外部环境和市场需求变化的反应不灵敏，进而也制约了企业与供应链上下游之间的协作水平[6]。
3.支持供应链管理的信息技术应用滞后(www.xing528.com)
我国企业特别是中小企业供应链信息管理和互联能力普遍较差，数据库的字段、类型等标准不一致，信息系统没有完全实现“联网”“上云”，导致大量“信息孤岛”的形成[7]。许多中小企业为了提高短期利润、节省成本，往往忽略信息系统方面的投资和对内部信息系统的优化、维护，信息化建设对供应链管理的支撑严重不足[8]。
4.供应链内企业间互信基础薄弱
许多企业把自身的信息和资源视为“商业机密”，缺乏供应链管理的开放意识，将业务外包当作“肥水流入外人田”[9]，企业之间没有形成良好的竞合关系，甚至常常出现利益对抗和非合作博弈[10]。我国企业的信用基础大都建立在人际关系上，支撑供应链管理的信用机制不够完善，真正的信用体系还没有建立起来，缺乏有效的激励和监督机制[11]。
5.相关部门行政职能条块分割现象严重
由于计划经济体制遗留的部门职能条块分割问题，供应链标准化工作被人为地分散在不同的管理部门，难以形成统一管理体系，例如条形码标准由中国物品编码中心负责，集装箱技术标准由交通部科学研究院设计，托盘技术标准由铁道部科学研究院承担。尽管我国已建立了供应链物流标识标准体系，但这些标准之间的统一和推广仍存在严重问题，兼容性和协同性偏低[12]。在供应链物流领域，由于不同物流运输网络的协同程度不足，装备标准不兼容，大大增加了物流供应链尤其是多式联运的成本[13]。
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