这是一场没有硝烟的战争。当时的情况是，CG的资金链一天天抽紧，一旦扛不住宣布破产，即进入破产拍卖程序，华大与其签订的收购协议就等同一张废纸。与此同时，CG的老对手Illumina又向美国加州南区地方法院提起诉讼，二度控告CG侵犯其专利权。这项专利权针对的是CG的组合探针锚点结扎读取的关键性技术，如果CG在诉讼中失败，华大就失去收购CG的价值和意义。
华大决定参与收购竞拍。竞拍的方式是暗拍，在连着两轮的报价之后，华大以微弱优势得标。华大最终给出的价格是每股3.15美元，而Illumina给出的价格是3.1美元，二者仅有5分钱的差距。华大采取的是现金要约收购的方式，完成收购要约需要满足各种前提，其中包括：流通中的普通股（按完全摊薄后）大多数愿意被出售、获得中国相关监管机构的批准、获得联邦反垄断机构根据1974年Hart-Scott-Rodin法案的确认及获得美国外资投资委员会的许可等等。即使华大已经和CG签约并开始进入报批流程，如果第三方跳出来跟CG的公众股东直接对话，表示愿意以更高的价格求购股票，也是存在风险的。竞拍数月之后，Illumina不甘心就此出局，带着3.3美元的最新出价又杀了回来。
Illumina此时开始在媒体造势，声称将CG卖给中国人等于泄露“可口可乐的秘方”，CG的一些股东借机表示华大开价过低，损害了股东利益，质疑CG管理层和董事会成员确定买家太过草率。2012年12月，硅谷颇有影响的《圣何塞信使报》刊登美中经济暨安全审查委员会两位委员撰写的社评，大意是华大由中国政府拥有和控制，可能带来生物武器威胁，呼吁CFIUS（外商投资委员会）严查此案。(www.xing528.com)
就在这时，Illumina的CEO Jay Flatley致信CG，洋洋洒洒列举了Illumina的收购优势，比如：比华大的出价高5%，拥有更强大的技术优势，无须美国政府审批，强大的资金实力等等。当时，华大能否融资成功仍不确定，Flatley的话句句敲在CG董事会的心上，他们要求在美国的收购方代表徐讯每6个小时报告一次中国方面的审批和融资进度。
当时正值美国的感恩节，一周后，当CG的董事过完节，一封由华大和其法律顾问合力完成、以尹烨署名的电子邮件发到了他们的邮箱。邮件中逐字逐条、有理有据地回应了Illumina对华大的指控，说明为何华大的收购最有利于股东、客户及雇员的利益，并质疑Illumina的收购仅仅是为了扼杀测序市场的竞争。最终，华大没有因为Illumina的报价而动摇，每股3.15美元的出价分文没涨。2013年3月18日，CFIUS最终批准了华大基因对CG的并购申请，Illunima也撤回了报价。
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