（1）耕地质量下降，连作障碍依然过重
由于耕地承包责任制缺乏耕地保护监督机制，耕地连作负荷过重，连作障碍经常发生，造成耕地质量下降，严重影响耕地的有效利用和潜在的生产能力。施用化肥方面也长期高于全国平均水平，虽然近年来上海市政府采取多种措施降低化肥农药的施用量，但由于长期大量使用化肥农药，土壤微生物群失调，导致田间病虫草害发生率和发生程度增大。土壤复种频繁，土壤生产负荷过重，引起连作障碍，从设施栽培连作障碍蔓延到大田蔬菜，障碍面积从点状局部发展到连片区域；部分土壤酸化趋势明显，导致土壤缓冲能力下降，大量营养元素淋失，造成土壤肥力下降，使得作物产量降低和品质下降，部分农药残留超标，给食品安全带来隐患。
郊区农村环境基础设施建设相对滞后，大量生活污水未经处理直排河道，大部分生活垃圾没有得到无害化处理，畜禽粪便污染河道现象还未得到根本治理。例如，农产品的农药残留问题突出，降低了产品质量，而且在大气、土壤、水体间的残留短期内难以消除；焚烧麦秸产生的烟雾对空气质量产生严重污染；农村尤其是城郊结合地区的环境脏乱差现象普遍，违法搭建现象严重，人居环境欠佳，与建设社会主义新农村的总体要求存在较大差距。此外，农村生活垃圾造成的环境危害日益严重。农村生活垃圾得不到集中有效处理，大多被任意丢弃，有的虽经堆积发酵，分解了部分有机垃圾，但大部分有害物质通过雨水淋溶流入河道、农田。
（3）水资源紧缺，污染严重
水是农业的命脉，是农业生产不可或缺的宝贵资源，农业水资源状况的好坏，不仅关系到农产品的质量安全，还关系到农业生产的可持续发展。目前上海的水资源面临诸多问题。尽管上海的水资源总量较为充沛，但可利用的淡水资源十分有限，仅占地表水资源的20%。从人均水资源拥有量来看，上海的人均淡水资源拥有量仅为145米3，比北京还少，大大低于全国人均2 200米3（世界人均8 840米3）的水平，也远低于国际公认的1 750米3的用水紧张线，全国排名仅为第23位。此外，由于上海地处长江、太湖两大河流下游，水质既受到上游水污染的影响，又有本地污染源的危害，是一个典型的水质性缺水城市。(www.xing528.com)
（4）生活污染是目前农村面源污染的重要来源
对上海市各郊区县四大污染源的调查研究，得出各污染源的排放量如表1-2、图1-2所示。上海地区各郊区县四大污染源产生的农业面源污染物数量达到 171 488.52吨，环境承载压力巨大。从调查结果分析，以农村生活产生的污染物最多，达到 129 299.8吨，占整个污染量的 75.4%，即使用等标排放量衡量之后，所占比重仍高达 66%；淡水养殖的排污为 4 952.23吨，占整个污染量的 2.9%，通过计算等标排放量以后，所占比重降低到 1.4%，对环境污染较小；化肥氮、磷污染、畜禽粪尿污染排污量分别占总量的 3.4%和 18.3%。因此，通过分析污染源发现，我们要重点加强对农村生活的排污管理，其次是畜禽粪尿污染的排污管理，再次是化肥氮、磷污染的排污管理，最后是淡水养殖的排污管理。
表1-2 上海地区农业面源四大污染源的排放量 （单位：吨）
图1-2 上海地区农业面源污染源排放比重
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