1.联通两大洋的航运枢纽区位优势。科隆很早以前只是被印第安人称为“迪亚斯”的一片荒芜之地。最初，西班牙人来此修建堡垒，把从拉美各地掠夺的金银财宝在这里集中，然后再运回到西班牙。19世纪初，拉丁美洲人民开始独立斗争，大哥伦比亚共和国成立，当时巴拿马只是其中的一个省。1852年，“迪亚斯”正式改名为科隆，1903年，巴拿马建立独立的共和国。巴拿马运河将大西洋与太平洋连接起来，成为世界航运上最繁忙的水道之一，而科隆自贸区位于巴拿马运河的咽喉地带，濒临大西洋且三面环海，具有国际贸易航运枢纽有利区位优势。
2.高效自由的自贸区管理模式。科隆自贸区海关办事机构只对进出口货物中与外界的联系通道进行监管，对区内货物的正常经营活动不加干预，豁免关税的范围相对较宽，并且自贸区的进出口手续简便快捷，通关效率很高。此外，科隆自贸区（含新太平洋自贸区）采取的是“政府管理”的模式，即中央政府直接管理自贸区。由中央某个部或者由几个部组成一个管委会，并由总统直接任命一个理事会负责有关事务，这样便于科隆自贸区协调各方面的关系，提高办事效率，同时也有利于整个国家的统一规划和建设。
3.优惠的税收政策与法律保障。一个国家税收优惠政策与设立自贸区的国家经济实力及经济发展阶段等方面紧密相关。对于市场经济相对成熟的发达国家，其总体经济实力较强且对外国投资的依赖性较弱，因此，实施的税收优惠政策就相对较少。相反，对于巴拿马这样的发展中国家，资金实力较弱，就需吸引外资，因此，在科隆自贸区内实行的税收优惠政策就较多。比如，巴拿马公司所得税平均为30%～40%，而在科隆自贸区内却只征收2.5%～8.5%；而且，除了车辆牌照税外，其余的销售税、增值税、不动产销售税以及企业和个人每月缴纳的市政税全部免除，只对烟酒、毒品和危害公共安全的物品征收关税。(www.xing528.com)
1925年巴拿马通过的第8号法令决定成立国家海商局。1948年第18号法令批准开设科隆自由贸易区，允许在区内开展转运和转口贸易活动以及有关的装配活动。此外，为了缓解20世纪晚期的衰落，巴拿马政府制定了一系列法律制度以及激励措施使科隆自贸区得以持续发展，例如《内销及外销工业奖励法》（1986年3月）、《加工区设立及营运特别法》（1992年11月）、《观光事业投资奖励法》（1994年6月）、《普遍化优惠奖励法》（1995年6月）、《外国人投资保护法》（1998年7月）以及《银行法》（1990年颁布，1998年修订）。此外，巴拿马政府制定了许多有利于区内客户经营的政策，例如客户在区内存款，任何自然人和法人可以不需公开身份，也不需公司营业执照以及只要公司雇佣10个巴拿马当地人就可以注册公司等。
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