四川自贸区同时还突出了制度创新核心任务，争取到159项重点改革试点任务，其重点主要在转变政府职能、双向投资、国际贸易、金融开放创新、创新创业、内陆与沿海沿边沿江协同开放等6个方面进行探索。
（一）切实转变政府职能。推进简政放权、放管结合、优化服务改革，建立行政权责清单制度，深化行政审批制度改革，最大限度取消行政审批事项。构建以社会信用体系为重点的事中事后监管体系。优化法治环境，建立统一集中的综合行政执法体系，建立健全廉洁监督。建设多方参与的社会治理新体系。
（二）统筹双向投资合作。提升利用外资水平，对外商投资实行准入前国民待遇加负面清单管理制度，着力构建与负面清单管理方式相适应的事中事后监管制度。进一步减少或取消外商投资准入限制，提高开放度和透明度。构筑对外投资服务促进体系，加强境外投资事后管理和服务。创新国际产能合作和园区国际合作机制，加快“中国标准”国际化推广，深化国有企业改革。
（三）推动贸易便利化。加快服务贸易创新发展，提升对欧服务贸易水平，建立完善服务贸易公共服务体系和贸易促进平台。促进人才等服务要素自由流动。积极发展跨境电子商务、保税售后维修业务等贸易新型业态，助力外贸转型升级。创新口岸服务机制，优化查验通关流程，创新检验检疫监管制度。(www.xing528.com)
（四）深化金融领域改革创新。促进跨境投融资便利化，增强银行、证券、保险等各类金融机构的金融服务功能，积极发展融资租赁、商业保理等新兴金融业态，探索建立新型金融风险监管机制。
（五）实施内陆与沿海沿边沿江协同开放战略。探索与周边地区产业合作新路径，增强产业辐射带动能力。构建综合物流服务体系，畅通国际开放通道，加快推进国际铁路运输重要枢纽、国际航空枢纽、国家开放水运口岸建设，大力发展多式联运。打造长江口岸现代航运服务系统，全面提升航运服务功能。
（六）激活创新创业要素。优化创新创业制度环境，加强国际科技合作平台建设。创新科技金融服务机制，引导金融机构探索开展科技企业信用风险管理服务。整合全球创新创业要素，构建全链条创新创业体系。
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