为了确保审核方案的有效实施，审核方案的目标应与质量管理体系的方针和目标相一致，并支持方针和目标。
确定审核方案的目标时，可以考虑以下因素：
1）管理的优先事项和重点项目。不同的时期，会有不同的工作重点，有需要优先考虑的、需要突出解决的问题。如当年重点是改善生产过程控制，则可以将加强生产过程的控制确定为审核方案的目标。
2）商业意图和其他业务意图。如组织经常以对重大项目投标作为工作重点，力图多中标和切实履行合同或争取成为大企业的供方，则可以把满足顾客要求以及检查与顾客有关的过程确定为审核方案的目标。
3）过程、产品和项目的特性，以及其变化。可以针对特定的产品、项目或合同开展专项审核，以确认该产品、项目或合同相关的管理体系要求是否得到满足；针对某一个或几个重要过程开展过程审核，以确定这些过程的要求是否得到满足。
4）管理体系要求。如组织计划获得ISO9001认证，那么审核方案的目标可以是检查质量管理体系是否具备ISO9001认证的条件。
5）法律法规和合同要求，以及组织承诺遵守的其他要求。国家有关规章规定组织生产的产品必须获得强制性产品认证，本组织决定当年内完成产品的认证工作，则可以将改进产品质量、建立符合产品认证规定的管理体系的要求确定为内审审核方案目标。(www.xing528.com)
6）供方评价的需要。为了保证供应商持续提供合格产品，可以对供应商进行审核，这样可以将促进供应商改进供货质量作为审核方案的目标。
7）相关方（包括顾客）的需求和期望。可以将满足顾客要求作为本组织某项审核方案的目标。
8）发生失效、事件和顾客投诉时所反映出的受审核方的绩效水平。可以将改善组织的薄弱环节，提高顾客满意度确定为审核方案目标。
9）受审核方所面临的风险。
10）以往审核的结果。
11）受审核的管理体系的成熟度水平。可以将改善管理的薄弱环节，提高管理水平确定为审核方案目标。
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