中观层面指的是区域的产业布局、生态体系、交通系统、公共服务等方面存在的问题，这涉及某一具体领域的问题，或可能包含着整个社会和经济领域的某个方面，对协同创新的具体内容的治理大有助益。
魏进平等从市场、行政、文化、生态四个方面探讨了京津冀协同发展过程中遇到的问题。行政方面的问题在于河北省的最高行政长官与京津行政长官级别不匹配，难以形成对等的官方合作和对话机制；市场方面的问题在于行政割据的原因导致区域内本能形成互补的协同发展资源要素难以自由流通；生态方面的问题在于河北省一直在承接和支持京津的发展，但是也面临自身发展、环保和脱贫等各类问题；文化方面的问题在于京津冀地区官场文化盛行，这使得以市场驱动的协同发展缺乏原始动力。[65]
刘伟在他的研究中通过建立产业承接力评价体系，认为河北省在京津冀协同发展的背景下存在京津产业转移承接能力不足的问题，具体有河北与京津经济发展存在差异导致的产业不匹配、京津冀区域内要素流动不平衡、河北省产业创新能力不足等问题。[66](www.xing528.com)
张贵等通过对比京津冀与长三角、珠三角的高技术产业的深度数据，发现京津冀落后于长三角、珠三角的原因在于区域发展不平衡、产业结构不匹配、市场缺乏活力和地方保护主义存在等，最后提出京津冀协同发展的路径是挖掘新引擎，催生新业态以及创造新模式。[67]
王延杰、冉希京为了分析京津冀三地区在公共服务上的差距，首先分析了其成因。因为人力、物力、财力配置失衡及财税制度的差异最终导致了京津冀三地公共服务水平和质量断崖式的落差，并认为正是这个落差阻碍着京津冀协同发展包括协同创新。若想降低三地公共服务的水平差异，实现真正的京津冀协同，必须深化财税体制改革，加强京津冀财政协同与公共服务项目合作。[68]
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