本节采用协同度模型分析了长三角地区自主创新与利用侨（外）资系统的协同度。结果表明，长三角地区中江苏复合系统的协同度呈现上下波动起伏，2004年、2005年及2013年呈现不协同，最高协同度为0.47886，尚未超过50%。上海复合系统的协同度呈现为逐年上升趋势，2010年后的协同度均超过0.5，2013年为最高，达到0.80022。浙江复合系统的协同度呈现出波动趋势，其中2013年表现为不协同。通过横向对比可以看出，江苏、浙江复合系统的协同度的变化趋势类似，都是呈现出波动态势，且2013年的协同度均为负数。上海复合系统协同度除了在2004年呈现出不协同外，其他各年均不断上升。
为了促进长三角地区的自主创新与利用侨（外）资的协同发展，本研究提出以下几点对策：
1. 长三角地区的企业、研究机构及大学与跨国公司的联合研发工作技术创新应以市场为导向。长三角地区的企业、研究机构、高等院校与跨国公司的合作应强化国际市场观念，能较快地追随国际先进技术，并融入到世界技术创新网络。通过合作，促进研发资源、设备、信息等共享，提高内资企业的自主创新能力。此外，跨国公司拥有先进的研发活动及网络的管理体系和模式。当长三角人员参与到跨国公司在本地的研发活动及管理时，必然会带动长三角地区产学研机构研发管理水平的提高。(www.xing528.com)
2. 充分利用跨国公司的技术溢出效应，促进产业协同采取有效措施来提升长三角地区内资公司与跨国公司的产业关联，使之融入到跨国公司的产业链中，如鼓励长三角地区中小企业引进国外领先技术，积极承接跨国公司的原材料及零部件生产，不断跟上国外的技术水平。通过聘请的国外专家到长三角地区的中小企业工作，来提高他们的生产及管理水平。
3. 不断优化环境，为长三角地区自主创新与利用侨（外）资的协同发展提供完善的基础条件。尽快打破条块分割，建立长三角地区统一开放的市场体系，使技术市场、人才市场、金融市场、商品市场等能更好地服务于对外开放，为长三角地区自主创新与利用侨资的协同发展提供完善的基础条件。进一步提高政府的服务水平与效率，建立健全“一站式办公”和“电子政务工程”。加强城市规划，创造一个有吸引力的居住环境，居住环境和商业环境一样重要。切实解决跨国公司研发人员的生活配套服务问题，为外资研发工作的顺利进行提供必要的保障。
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