（1）缺乏管理能力。创业人员不懂企业管理知识，管理经验不全面，不能很好地管理企业，在企业运行时往往没有宏观的判断，没有清晰的方向感，发现问题不能及时采取行动造成管理缺失。创业活动主要有两种：一是创业者利用某一新技术进行创业，他可能是技术方面的专业人才，但却不一定具备管理才能，从而形成管理缺失；二是创业者往往有某种“奇思妙想”，可能是新的商业点子，但在整体规划上不具备相应的才能，或不擅长管理具体的事务，从而形成管理缺失。
（2）缺乏技能和专门知识。不会管理资金、人员、机器、库存、成本核算，不能有效了解市场需求。中国农民整体受教育水平不高、知识储备不足、信息量不够，一些农民缺乏创业所必备的技术和技能，在创业过程中仅凭自己的主观判断确定投资领域和方向，从而导致创业失败。
（3）市场信息不准。信息是人类社会的一种宝贵资源，同样也是现代化管理的重要资源。信息的共同特征有时效性、共享性、转化性、无限性、传递性、存储性、再生性、压缩性、利用性等。创业者如果不能及时了解市场需求信息及其变化，容易造成产品销售不出去或卖不了好的价格。对技术含量低的农产品跟风种植时一定要看好市场，随时了解行情，最好不在高峰期种植，可提前一个月或推迟一个月，要在技术上做文章。
（4）产业规模不当。中小型企业规模小，很难形成纵向一体化，无法规模化生产，企业各项成本费用过高，人力资源管理水平相对落后。一些小型企业受资金和规模的限制，硬件设施、相应的软件（如企业文化、企业管理理念和手段等）往往落后于大型企业。(www.xing528.com)
此外，小型企业中相当大比例的管理人员是企业所有者的亲属或友人，企业重要岗位上任人唯亲的现象非常普遍。有些企业的最高领导者身兼数职，一人负责企业的生产、管理、财务和销售。这种家族式管理和个人集权化的管理方式，在小型企业发展初期起到了良好的促进作用，客观上有利于企业的发展，但是随着企业的不断发展壮大，这些管理方式的弊端就逐渐显露出来了。
许多小型企业并不具备独立的产品开发能力，市场开拓能力也相当有限，经营完全以盈利为唯一目的，往往很少考虑和进行长远规划，容易造成企业业务频繁更换的情况，对于市场和技术的变化风险抵抗力差，不利于企业的长期、持续性发展。
（5）自然灾害袭击。农业企业受自然影响最大，如果业主没有为企业投保，受到旱灾、水灾、病虫害、疫情或其他灾害时，企业将受到重大损失。农产品生产的周期性、自然灾害的客观存在、农业生产力水平较低，这些都会给农民带来风险。有些自然灾害是可避免的，有些是不可避免的，农民单家独户所面临的风险更大。这些自然灾害对农业创业公司可能会带来灭顶之灾。
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