痛哭六军具缟素，冲冠一怒为红颜。
——（清）吴伟业《圆圆曲》
李自成率军进入北京城，受到穷苦百姓的热烈欢迎。他下令追缴明朝官员财富，规定罪大恶极的处死，财产没收，危害民众的严刑追赃，民愤不大的，听其自行捐献。但是，一些命令执行下去就变了样，手下人不分青红皂白，不加区别，甚至采用严刑逼供，，使明朝官绅人人自危。有的人领还趁机强占人家的家眷，霸占豪宅，过着骄奢淫逸的生活。士兵们也失去了旺盛的斗志，军心涣散，纪律松弛。李岩等将领对这些问题提出意见，但没有引起李自成的重视。
李自成进京后，想借重明朝大将吴三桂的兵力镇守山海关，阻止清兵入关。他让吴三桂的父亲写诏书，劝吴三桂投降。吴三桂收到父亲的信，很犹豫，不知道该不该投降。想来想去，他决定亲自到北京去看看情况再说。
刚刚走到滦州（今河北滦县），吴三桂就听说他的家产被抄，恨得咬牙切齿；又听说他最宠爱的歌姬陈圆圆也被起义军抓走，更是气急败坏。他返回山海关，消灭了山海关的农民军，并且要将士们一律换上白盔白甲，说是要给死去的崇祯帝报仇。(www.xing528.com)
李自成得知吴三桂拒绝投降，决定亲自带20多万大军，进攻山海关。他亲自率领军队进攻山海关东面，又派另一支军队越过山海关，准备前后夹击。
吴三桂认为自己孤军奋战，要面对农民军，还要防备清军的进攻，必败无疑。于是，他决定投降清军，一起对付农民军。想到这里，吴三桂立刻写信与关外的清军联系。清军统帅多尔衮正虎视眈眈地盯着中原这块土地，看到这样好的机会，便立即答应了吴三桂的请求，带着十多万大军赶往山海关。
李自成大军从南面开到山海关边，军容威武。多尔衮见起义军阵容坚强，就让吴三桂打先锋，叫清军埋伏起来。起义军个个血战，喊杀声震天动地。正在这时，天空刮起了大风，飞沙走石，一片昏暗。埋伏在后面的清军，突然冲杀出来。大顺军顿时乱了阵脚，纷纷向后溃退。清军和吴三桂的军队加紧追杀，被砍杀、射死、被战马踏死的不计其数，血流成河。
李自成大败后撤回北京这时，大顺军元气大伤，各种反对势力蠢蠢欲动。李自成认为北京已守不住了，便决定放弃北京，回到西安以图再起。临行前，他匆匆忙忙地在武英殿登基称帝，然后离开北京向西安撤退。
多尔衮在吴三桂的帮助下进了北京，当年就将都城迁到北京，开始了清王朝在全中国的统治。
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