1958年底，中国科学院所属的北京微生物研究室与应用真菌研究所合并成立微生物研究所。张树政随研究室一起从设在北京动物园的北京微生物研究室原址迁往中关村。
微生物研究所成立之初，张树政在新所生理生化研究室的主要研究任务是甘油发酵。虽然早在第一次世界大战时欧洲已经为生产军火而用发酵法生产过大量甘油，但我国一直没有人进行过系统的实验研究。在大跃进的形势下，张树政接受了用耐高渗透压酵母菌生产甘油及阿拉伯糖醇的研究任务。在以擅长酵母菌研究的方心芳指导下，由王惠莲和杨廉婉等人进行实验。他们从分离筛选菌种开始，一直到进行100升发酵罐的中间试验。他们从自然界分离了耐高渗压酵母菌630株，经过筛选找出21株多元醇产量高的酵母菌，其中有一株在发酵液中产生多元醇的含量达10%以上。又从所内保藏的800余株酵母菌中筛选到甘油产量特别高的菌株。进而又对高产菌株进行了产生多元醇的条件试验。在最适情况下，30%的葡萄糖发酵4日可产生10%左右的多元醇，糖转化率为33%，但主要是阿拉伯糖醇，甘油浓度仅1%左右。1960年他们用另一株筛选到的酵母菌进行了中试，甘油对糖的转化率接近30%。1961年以后，张树政领导的这项研究转向基础，他们用两株高产多元醇的酵母菌研究了糖代谢途径，他们测定了两株耐高渗酵母菌无细胞提取液中EMP及磷酸戊糖循环的酶活力，发现它们均有联系NADP的多元醇脱氢酶，催化二羟丙酮还原为甘油或催化D－核酮糖还原为D－阿拉伯糖醇。这些工作，对后来发酵法生产甘油的研究有一定参考价值，更有意义的是，他们通过这一课题，建立起研究糖代谢的各种方法，为后来的白地霉戊糖代谢研究准备了条件。(www.xing528.com)
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