阴阳学说贯穿在中医理论体系的各个方面，用来说明人体的组织结构、生理功能、病理变化，用于对疾病的诊断和治疗。
（一）说明人体的组织结构
人体是一个有机整体，整个人体及其各部分组织结构具有阴阳对立的关系，均可以阴阳作具体的划分（如表2-1），如体表为阳，体内为阴；身体上半部为阳，下半部为阴，肝脾肾在下为阴；心为阳中阳，肺为阳中之阴。每一脏还包含着阴阳，如心阴，心阳，肝阴，肝阳等。经络之中，经属阴，络属阳，而经中又有阴经与阳经，络中又有阴络与阳络。在形体与内含物之间，形为阴，气为阳；有形的精血、津液为阴，无形的气和神为阳；在气之中，营气在内为阴，卫气在外为阳等等。
表2-1 人体组织结构与阴阳属性
入门歌诀
人体组织结构与阴阳
人体结构分阴阳，体内为阴表为阳，
上体为阳下体阴，腹为阴而背为阳。
五脏六腑分阴阳，五脏为阴腑为阳，
具体脏腑阴阳配，体阴用阳再分详，
有形精血津属阴，功能神气视为阳。
（二）说明人体的生理功能
人体的生理活动虽然复杂，但都可概括为阴精和阳气的矛盾运动，“阴”即“阴精”，机体的组织结构和血液、津液等物质属于阴；“阳”即“阳气”，指物质运动及其所发挥的功能。二者是相对立而又相依存。人体的阴精和阳气的矛盾运动，在正常的生理状态下，维持着相对动态平衡协调状态，《内经》称之为“阴平阳秘，精神乃治”。
每一个脏腑本身阴阳协调，才能维持其生理功能正常。心阴、心阳、肝阴、肝阳等，阴阳协调，脏腑生理功能正常。
入门歌诀
人体生理功能与阴阳
阴阳学说论生理，阴精阳气协调成，
人之生长壮老已，皆由阴阳二气定。
物质基础是阴精，能量充足阳之根，
无阳则阴无所化，无阴则阳无以生。
阴平阳秘寿而康，精神乃治赖平衡。
（三）说明人体的病理变化
人体的一切病理变化，也是阴阳矛盾运动的结果。无论外感病或内伤病，其病理变化的基本规律，不外乎阴阳偏盛或偏衰，称之为“阴阳失调”，阴阳失调是一切疾病发生的根本病理变化。
引起疾病发生的原因称为病因，泛指邪气，邪气有阴邪（如寒、湿）和阳邪（如风、暑）之分。人体对疾病的抵抗能力称为正气，正气亦有阴精和阳气之别。
1．阴阳失调 《素问·阴阳应象大论》说：“阳胜则热，阴胜则寒；阳虚则寒，阴虚则热。”说的是阴阳一方偏亢过盛，对另一方制约太过可致病；阴阳一方偏衰，无力制约对立的另一方，同样可以导致疾病的发生。
（1）阳胜则热：一般是指阳邪致病，导致阳的绝对亢盛，从而出现热的表现，如暑邪伤人，出现壮热、面红、口渴等实热证。
（2）阴胜则寒：一般是指阴邪伤人，导致阴的绝对偏盛，从而出现寒的表现，如寒邪伤人，出现恶寒，口淡不渴，腹部冷痛等实寒证。
（3）阳虚则寒：指机体的气不足，不能温煦，或阳虚不制阴，阴相对亢盛，也表现为寒象，如面色苍白、畏寒、形寒肢冷等，形成虚寒证。
（4）阴虚则热：指阴虚不足，阴不制阳，导致阳的相对亢盛，从而出现虚热的症状，如五心烦热，潮热盗汗，口咽干燥等。
2．阴阳互损 根据阴阳互根的原理，机体的阴或阳任何一方虚损到一定程度，必然导致另一方的不足，称之为阴阳互损。如气属阳，血属阴，气虚生血不足，导致血虚，称之为阳损及阴等。
阴损及阳，系指由于阴液（精、血、津液）亏损，累及阳气生化不足，或阳气无所依附而耗散，从而在阴虚的基础上又导致了阳虚，形成了以阴虚为主的阴阳两虚病理状态。
阳损及阴，系指由于阳气虚损，无阳则阴无以生，久之则阴液生化不足，从而在阳虚的基础上又导致了阴虚，形成了以阳虚为主的阴阳两虚病理状态。
3．阴阳转化 阴阳转化是阴阳失调所表现的病理变化之一。在一定的条件下，阳证可以转化为阴证，阴证也可以转化为阳证。例如某病人因受凉感冒，症见恶寒、发热、头痛等，由于治疗不及时，两三天后，上述症状消失，却又出现咳喘、胸闷、咳痰表现。前者病位在表，属阳证；后者病邪入里，属阴证。此即阳证转化为阴证。再如某病人患咳喘日久，咳喘每于冬季加重，夜间发作极甚、怕冷、咳吐大量清稀痰。近日由于天气剧变，咳喘症状加剧，痰稠色黄、发热、体温39℃、面赤、口渴喜冷饮、舌红苔黄、脉滑数。此人原来的证为肺寒，属阴证；现证为肺热，属阳证，此即由阴证转化为阳证的过程。此外，如表证与里证、虚证与实证的相互转化亦属阴阳转化之机。
（四）用于疾病的诊断
阴阳学说用于疾病的诊断，主要包括：
1．诊察疾病的基本方法 《素问·阴阳应象大论》说：“善诊者，察色按脉，先别阴阳。”例如，望色泽的阴阳属性：色泽鲜明红赤属阳（热、实），晦暗淡白者属阴（寒、虚）。脉数属阳（热），脉迟属阴（寒）。中医诊察疾病的基本方法是望、闻、问、切，均可区别阴阳。
2．辨别证候的阴阳属性 在八纲之中，以阴阳为总纲，即表、实、热证为阳证；里、虚、寒证为阴证（如表2-2）。
表2-2 阴阳学说与疾病诊断
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病理变化与阴阳
人体为何生疾病，阴阳失调是根本。
阴阳偏胜或偏衰，失去平衡疾病生。
阳邪亢盛生实热，阴邪盛时寒亦深。
机体阳气虚衰时，形寒肢冷虚寒成；
阴分不足难制阳，潮热盗汗内热生。
阴阳虚损互影响，阴损及阳阳及阴，
慢性疾病阴阳虚，乃因阴阳互损成。
阴证阳证可转化，临证之时须留心。
（五）用于疾病的治疗
由于疾病的根本机制是阴阳失调，所以治疗疾病的根本原则是调整阴阳，以恢复阴阳的平衡协调。
1．确定治疗原则 阴阳偏胜的治疗原则是“损其有余”。因阳胜则热，故治疗原则是“热者寒之”；阴胜则寒，故治疗原则是“寒者热之”。阴阳偏胜均为实证，故可概括为“实则泻之”。
从总的来说，阴阳在祖国医学上的应用，是一个机动的代名词，一种思想方法。前人认识到一切事物和现象，都是相互对立的，有内就有外，有上就有下，……应用在医学上，有寒就有热，有虚就有实。有形质就有功能，……故通过阴阳学说在医学上的反映，去理解古代医家积累起来的丰富经验，是极其重要的一环。——著名中医学家、中医教育家·秦伯未
阴阳偏衰的治疗原则是“补其不足”。阴虚则热，为虚热证，治当滋阴扶阳；阳虚则寒，为虚寒证，治当补阳制阴。阴阳偏衰均为虚证，又可概括为“虚则补之”。
2．归纳药物性能 药物的性能一般包括四气（性）、五味、升降浮沉。
［药性］ 主要是寒、热、温、凉，其中寒凉属阴，温热属阳。
［药味］ 药味主要包括酸、苦、甘、辛、咸五味，有些药物为淡味，其中辛、甘、淡属阳，酸、苦、咸属阴。
［升降浮沉］ 在体内发挥作用的趋向概括为升降浮沉，升是向上，浮是向外浮于表，降是向下，沉是向内沉于里，升浮属阳，沉降属阴（表2-3）。
表2-3 药物性能归纳表
总之，治疗疾病，就是根据病证的阴阳的偏胜偏衰情况，确定治疗原则，再结合药物性能的属性，选择相应的药物，以纠正由疾病引起的阴阳失调状态。
入门歌诀
诊治疾病与阴阳
察色按脉巧断病，先辨阴阳最要紧。
色泽鲜明属阳证，色白晦暗断为阴，
息粗身热脉洪数，表实热证皆阳证，
语音低微气息弱，里虚寒证统归阴。
八纲辨证最重要，总纲还需阴阳定。
谨察阴阳定治则，以平为期求平衡。
阴阳偏盛见实证，损其有余实则泻，
热者寒之清实热，寒者热之疗寒证。
阴阳偏衰显虚形，补其不足虚则补，
阴虚独阳难潜伏，滋阴护阳法可循，
若为阳衰难制阴，助阳消阴亦可行。
泻其有余补不足，协调阴阳复平衡。
临床用药数千种，性能概括阴阳分，
四气寒凉与温热，温热为阳寒凉阴，
辛甘发散皆属阳，酸苦涌泄属于阴，
咸味为阴淡味阳，升浮为阳沉降阴。
治病用药明阴阳，药到病除疴疾平。
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